SES正社員とフリーランスSESの違い｜年収・安定性・自由度を比較

「SES正社員のままでいいのか、フリーランスに転向すべきか」——SESエンジニアとして経験を積む中で、多くの方が一度はこの悩みにぶつかります。

結論から言えば、どちらが優れているかではなく、あなたのスキル・経験・ライフステージによって最適な選択が変わります。この記事では、SES正社員とフリーランスSESの違いを年収・安定性・自由度・福利厚生の4軸で徹底比較し、あなたに合った働き方を見つけるための判断材料を提供します。

SES正社員とフリーランスSESの違い早見表

まず全体像を把握しましょう。

比較項目	SES正社員	フリーランスSES
年収（経験5年）	450〜600万円	600〜900万円
収入の安定性	◎（月給制・待機中も支給）	△（案件切れ＝収入ゼロ）
案件の選択自由度	△（会社の方針に従う）	◎（自分で選べる）
福利厚生	◎（社保・退職金・研修）	×（全額自己負担）
マージン	30〜50%（企業が取得）	10〜20%（エージェント手数料）
営業活動	不要（営業担当が対応）	必要（自分 or エージェント経由）
確定申告	不要（年末調整）	必要（毎年）
スキルアップ支援	あり（研修・資格補助）	なし（自己投資）

この表だけでは判断が難しいと思いますので、以下で詳しく解説していきます。

SES正社員の特徴

メリット（安定収入・福利厚生・研修）

SES正社員の最大のメリットは安定性です。

• 毎月の固定給が保証される: 案件が途切れても（待機中でも）給与が支払われる
• 社会保険が完備: 健康保険・厚生年金・雇用保険の会社負担分あり
• 退職金制度: 長期勤務で退職金が積み上がる
• 研修・資格取得支援: 会社負担で研修を受けられ、資格取得の報奨金制度がある企業も
• 有給休暇: 法定通りの有休が付与される

特に経験が浅いうちは、研修を受けながら実務経験を積めるのは大きなアドバンテージです。未経験からSESに入り、最初の2〜3年で基礎を固めるという選択は非常に合理的です。

デメリット（マージン・案件選択の制限）

一方で、正社員ゆえの制約もあります。

• マージン率が高い: クライアントが支払う単価の30〜50%が企業の取り分。手取りに反映されにくい
• 案件を選べない: 会社が決めた案件にアサインされることが多い
• 昇給が緩やか: 年功序列的な給与体系の企業では、スキルアップが年収に反映されにくい
• 商流が深いと単価が下がる: 2次請け・3次請けになるほど、エンジニアに還元される金額が減る

「自分の単価は70万円なのに、手取りは月30万円台」——こうした不満がフリーランス転向のきっかけになるケースは少なくありません。

フリーランスSESの特徴

メリット（高単価・案件選択の自由・働き方）

フリーランスSESの最大の魅力は高い報酬と自由度です。

• 手取りが大幅に増える: エージェント手数料（10〜20%）のみで、残りが自分の売上
• 案件を自分で選べる: 技術領域・勤務地・働き方を自分で決定できる
• 単価交渉ができる: スキルに見合った報酬を直接交渉可能
• 経費計上で節税可能: PC・書籍・通信費などを経費にできる
• 働き方の柔軟性: 案件間に長期休暇を取ることも可能

フリーランス協会の「フリーランス白書2025」によると、IT系フリーランスの約70%が「収入が増えた」と回答しています。

デメリット（営業負担・保障なし・確定申告）

しかし、自由には責任が伴います。

• 案件が途切れると収入ゼロ: 待機中の給与保証はない
• 社会保険が全額自己負担: 国民健康保険・国民年金は全額自分で支払い
• 退職金・有給休暇なし: 休めば収入が減る
• 営業活動が必要: エージェントを使うにしても、面談対応やスキルシート更新は自分
• 確定申告が必須: 毎年の確定申告作業（または税理士への依頼費用）
• 2024年施行のフリーランス保護新法（厚生労働省）で環境は改善しつつあるが、正社員ほどの保護はない

年収シミュレーション比較

具体的な数字で比較してみましょう。SESエンジニアの年収データを参考にシミュレーションします。

経験3年の場合（Javaエンジニア）

項目	SES正社員	フリーランス
クライアント単価（月）	55万円	55万円
マージン率	40%（22万円）	15%（8.25万円）
月収（額面）	33万円	46.75万円
年収（額面）	約400万円 +賞与	約561万円
社保・年金（自己負担）	約5万円/月	約8万円/月
退職金積立相当	あり（月2〜3万円相当）	なし
実質年収差	—	+約80〜120万円

経験3年の段階では、フリーランスの方が年収は高くなりますが、差はそこまで大きくありません。保障の差を考えると正社員のコスパが良いとも言えます。

経験5年以上の場合（クラウドエンジニア）

項目	SES正社員	フリーランス
クライアント単価（月）	75万円	80万円（直接契約で高め）
マージン率	35%（26.25万円）	12%（9.6万円）
月収（額面）	48.75万円	70.4万円
年収（額面）	約585万円 +賞与	約845万円
実質年収差	—	+約200万円以上

経験5年以上でスキルが高い場合、年収差は200万円以上になることも珍しくありません。SESの単価相場を確認し、自分のスキルに見合った報酬を得られているか確認しましょう。

ライフステージ別おすすめの選び方

20代・経験浅い → 正社員がおすすめ

20代やIT業界経験が浅い段階では、SES正社員として基盤を固めるのが得策です。

• 研修制度を活用してスキルを磨ける
• 失敗してもリスクが小さい（給与は保証される）
• ビジネスマナーやプロジェクト経験を積める
• 職務経歴書に書ける実績を作れる

この時期に大切なのは、年収よりも経験値の蓄積です。

30代・スキルあり → フリーランスも選択肢

以下の条件を満たすなら、フリーランスへの転向を検討する価値があります。

• 実務経験5年以上（設計・構築フェーズの経験あり）
• 得意な技術領域が明確（クラウド、AI、セキュリティ等）
• 貯蓄に余裕がある（最低6ヶ月分の生活費）
• 自己管理ができる（スケジュール・健康・確定申告）
• 営業・人脈がある程度ある

フリーランスSESについて詳しくはSES正社員とフリーランスの違いやフリーランス独立ガイドも参考にしてください。

正社員からフリーランスへの転向タイミング

「いつフリーランスになるべきか」は多くのエンジニアが悩むポイントです。以下のチェックリストで判断してみてください。

転向してOKのサイン:

• ✅ 現在の単価が60万円以上（市場で通用するスキルがある）
• ✅ 同じ技術領域で3年以上の実務経験
• ✅ 案件終了後2週間以内に次の案件が見つかる自信がある
• ✅ 半年分以上の生活費を貯蓄している
• ✅ フリーランスエージェントに相談済み

もう少し待った方がいいサイン:

• ❌ 特定の技術に自信がない
• ❌ スキルシートに書ける案件が2件以下
• ❌ 営業やコミュニケーションが苦手
• ❌ 住宅ローン審査や大きな出費を控えている（審査は正社員の方が有利）

現場のリアルとして、フリーランスに転向したエンジニアの約80%が「もっと早く転向すればよかった」と感じる一方で、約15%が「準備不足だった」と後悔しています。焦らず、しっかり準備を整えてから一歩を踏み出しましょう。

まとめ

SES正社員とフリーランスSES、それぞれに明確なメリット・デメリットがあります。

判断基準	SES正社員向き	フリーランス向き
経験年数	3年未満	5年以上
重視するもの	安定・成長環境	年収・自由度
リスク許容度	低い	高い
営業力	苦手	ある程度ある
ライフステージ	住宅購入前・結婚前後	生活基盤が安定

大切なのは、今の自分に合った選択をすることです。正社員で経験を積みながら、フリーランスへの転向を視野に入れてスキルアップを続ける——これが多くのSESエンジニアにとって現実的なキャリア戦略です。

SES BASEでは、正社員向け・フリーランス向けの両方のSES案件情報を掲載しています。あなたのキャリアステージに合った案件を探してみてください。

※参考: フリーランス協会「フリーランス白書2025」、厚生労働省「フリーランスとして安心して働ける環境を整備するためのガイドライン」、doda「平均年収ランキング2025」

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